Desde el punto de vista institucional, su órgano superior es la Asamblea de Socios. Una vez al año se lleva a cabo la Asamblea General Ordinaria, donde se ponen a consideración de los socios los acontecimientos sucedidos a lo largo del período por medio de la Memoria y Balance Anual.
Los directivos se reúnen para la renovación parcial de las autoridades del Consejo Directivo de la Institución.
Si bien la Asamblea es el órgano superior, los destinos de la institución deben ser gobernados en forma periódica, y a ese efecto existe el Consejo Directivo de la Entidad, que se reúne en forma mensual para tratar todos los temas referidos a la misma.
Compuesto por Doce Miembros Titulares y, para mantener el equilibrio de los distintos sectores que componen a la Bolsa, se designan:
Dos por el Acopio de Granos
Dos por el Corretaje de Granos
Dos por las Cooperativas Agropecuarias
Dos por la Producción Agrícola
Dos por la Exportación de Granos
Un socio por la Industria Aceitera
Un socio por la Industria Molinera
Por cada uno de ellos, se designa un miembro suplente.
En colaboración con el Consejo Directivo actúa la Mesa Ejecutiva, integrada por los seis primeros miembros de aquel.
Encargada de fiscalizar la administración de la entidad.
Maximiliano Abraham
Fernando Souza
Paul Gastón Larbiou
Dolores Valdemoros
Mariano D'Amore
Pedro Martínez
Leonardo Simón
Rubén Iribe
Alejo Soto
Esteban Niemela
Jorge Grimberg
Juan Pablo Vélez
Mauricio Haedo
Fidel Larrivey
Marcelo Insausti
Sebastián Valero
Guillermo Zuntini
Marcelo Salustro
Fabián Weimann
Juan Pablo Gutiérrez
Silvio Mélida
María Juliana Milla
Fernando Belussi
Fernando Gabriel Gatti
Leonardo Cebrián
Guillermo Vaylet
Cristian Mascaró
Patricio Rodríguez
Lautaro Díaz
Lucas Haag (*)
(*) Por dos años